Nationalspieler Müller fehlte dem Rekordmeister zuletzt wegen muskulärer Beschwerden am linken Hüftbeuger, Choupo-Moting war wegen Kniegelenkbeschwerden ausgefallen.
Beide Profis verpassten daher die Asienreise der Bayern. Müller hatte Mitte Juli das Trainingslager am Tegernsee wegen seiner Hüftprobleme vorzeitig verlassen.
Der Supercup am Samstag (20.45 Uhr/Sky und Sat.1) gegen DFB-Pokalsieger RB Leipzig dürfte für Müller (33) und Choupo-Moting (34) deutlich zu früh kommen.