Bereits am Mittwoch hatte der Stürmer eine Übungseinheit nach einer knappen halben Stunde abbrechen und sich in ärztliche Behandlung begeben müssen.
Mit zehn Treffern ist der Olympia-Zweite von Rio de Janeiro der erfolgreichste Torschütze der Norddeutschen.
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Werder-Trainer Alexander Nouri dürfte Gnabry durch Routinier Claudio Pizarro ersetzen.
Serge Gnabry im Steckbrief