"Michael ist wunderbar für den nordirischen Fußball. Er hat unseren Traum wahr gemacht, wieder bei einer großen Meisterschaft zu spielen", sagte FA-Präsident Jim Shaw.
O'Neill hatte den Posten im November 2011 angetreten und mit der "Green and White Army" die Qualifikation zur Euro 2016 geschafft. Zuletzt waren die Nordiren bei der WM 1986 auf großer Bühne vertreten.
Bei der EM trifft Nordirland auf Polen (12. Juni), die Ukraine (16.Juni) und die DFB-Auswahl (21. Juni).