Martins Rückstand auf Cancellara betrug im Ziel knapp fünf Sekunden.
Der gebürtige Cottbuser übernahm auch aufgrund eines Sturzes des bisherigen Spitzenreiters Luis Leon Sanchez (Spanien/Astana) dennoch die Führung in der Gesamtwertung. Der viermalige Tour-Etappensieger war an einem Wendepunkt zu Fall gekommen und musste zur Behandlung in ein Krankenhaus gebracht werden. Genaue Angaben zu seinen Verletzungen lagen zunächst nicht vor.
Die 4. Etappe führt am Samstag über 194 km von São Brás de Alportel nach Tavira, im Ziel dürfte der zum Auftakt siegreiche Marcel Kittel (Arnstadt/Etixx) wieder um den Sieg sprinten. Die Rundfahrt endet am Sonntag mit einer Bergankunft in Alto do Malhão.