Im Duell der Topfavoriten landete der zweimalige Tour-Sieger Alberto Contador (Spanien/Tinkoff) auf Platz fünf (+0:11 Minuten) und fuhr vier Sekunden Vorsprung auf den früheren Giro-Sieger Nairo Quintana (Kolumbien/Movistar) heraus, der Achter wurde. Vorjahressieger Joaquim Rodríguez (Spanien/Katjuscha) kam zeitgleich mit Quintana als Achter ins Ziel.
Die dritte Etappe führt am Mittwoch über 193,5 zunächst flache, im Finale dann hügelige Kilometer von Vitoria-Gasteiz nach Lesaka. Die Rundfahrt endet am Sonntag mit einem Zeitfahren in Eibar.