Wawrinka erholt sich noch von einer Operation am linken Fuß, sein bislang letztes Match bestritt er im März in Doha.
Bei den Männern werden in Tokio unter anderem auch Grand-Slam-Rekordchampion Rafael Nadal (Spanien), US-Open-Sieger Dominic Thiem (Österreich) und der Weltranglisten-Zwölfte Denis Shapovalov (Kanada) fehlen.
Der Schweizer Superstar Federer will erst nach Wimbledon über einen Olympia-Start entscheiden.
Bei den Frauen haben bereits die Weltranglisten-Dritte Simona Halep (Rumänien) und die 23-malige Grand-Slam-Gewinnerin Serena Williams (USA) ihren Verzicht verkündet.