Der Verein "und nicht zuletzt das Betreuerteam und die Mannschaft, mit der Thomas Wilhelmi so lange und intensiv zusammengearbeitet hat, sind in tiefer Trauer", sagte der Vorstandsvorsitzende Jan-Christian Dreesen. Wilhelmi habe "einen unschätzbaren Beitrag zum Gewinn der vielen Titel in dieser langen Zeit" geleistet.
Bei den Bayern arbeitete er unter anderem mit den Trainer-Größen Jupp Heynckes, Louis van Gaal, Pep Guardiola, Ottmar Hitzfeld und Carlo Ancelotti zusammen. Für Stars wie Bastian Schweinsteiger, Franck Ribery, Arjen Robben und Manuel Neuer sei er "in Reha-Phasen eine wichtige Stütze" gewesen. Vor seiner Zeit in München hatte er für Bayer Leverkusen gearbeitet.
