Kolo Muani hatte bei seinem ersten Treffer für den neuen Arbeitgeber Glück - nach einem Pfostenschuss des früheren Dortmunders Achraf Hakimi fiel ihm der Ball vor dem leeren Tor vor die Füße.
Hakimi (8.) und Goncalo Ramos (47., 89.) trafen ebenfalls für Paris, das nach sechs Spieltagen zwei Punkte hinter Spitzenreiter Stade Brest auf Tabellenplatz drei liegt.
Kolo Muani war kurz vor der Schließung des Transferfensters für eine Ablöse in Höhe von 95 Millionen Euro in die französische Hauptstadt gewechselt.
Sein neuer Sturmpartner Mbappé verletzte sich bei einem Zusammenprall mit Marseilles Verteidiger Leonardo Balerdi am linken Fuß und musste in der ersten Hälfte vom Feld. Zuvor hatte der 24-Jährige in vier Ligaspielen sieben Tore erzielt.
