Henao war mit sechs Sekunden Vorsprung auf Contador gestartet.
Contador (33) hatte bereits 2008, 2009 und 2014 bei der traditionsreichen Rundfahrt triumphiert. In diesem Jahr ließ er in der Gesamtwertung Henao (+12 Sekunden) und Quintana (+37 Sekunden) hinter sich.
"Es ist unglaublich. Ich war zu Beginn des Rennens nicht sicher, wie meine Form ist, aber sie ist so, wie sie sein muss", sagte Contador, der zu Rekordsieger Jose Antonio Gonzalez aufschloss, der in den 70er Jahren ebenfalls viermal im Baskenland gewonnen hatte.