"Meine Information ist, dass er in zwei, drei Tagen wieder auf dem Platz stehen wird", sagte Flick am Montag auf dem DFB-Campus in Frankfurt/Main.
Schlotterbeck sollte Spitzenreiter Dortmund im Ligagipfel bei Verfolger Bayern München am Samstag (18.30 Uhr) damit zur Verfügung stehen.
Der 23-Jährige war am vergangenen Samstag im Länderspiel gegen Peru in Mainz (2:0) kurz vor dem Ende mit Problemen im linken Oberschenkel ausgewechselt worden.