Stöckle hatte bereits die Bayer-Profis Patrik Schick und Arthur unter dem Messer.
Boniface hatte die Blessur im Training der nigerianischen Nationalmannschaft erlitten und war daraufhin zur Werkself zurückgekehrt.
Der Mittelstürmer verpasst nicht nur den Afrika-Cup (13. Januar bis 11. Februar), sondern auch weite Teile der Bundesliga-Rückrunde.
Boniface wird nun im Laufe der Woche nach Leverkusen zurückkehren, wo er im klubeigenen Rehabilitations- und Trainingszentrum mit der Behandlung starten wird.